El departamento de Finanzas, Servicios Centrales, de la división de Servicios Centrales, Asuntos Fundamentales, del Departamento de Sanidad, se ocupa de la presupuestación, la gestión de tesorería y la contabilidad, la contabilidad de costes y resultados, el apoyo a las organizaciones asistenciales no estatutarias en el ámbito del VIH/ITS y la prostitución, las tecnologías de la información y la comunicación y la administración general (adquisiciones y gestión de edificios).