Il Dipartimento per la Protezione dalle Infezioni e l'Igiene Ambientale è responsabile della protezione dalle infezioni e dell'igiene dell'acqua potabile e dell'ambiente. I suoi compiti comprendono l'identificazione, la consulenza e la registrazione delle malattie soggette a notifica, il monitoraggio dell'igiene delle strutture, il coordinamento della rete MRE di Stoccarda, la consulenza sulle vaccinazioni per gli adulti, il controllo delle pandemie, la medicina ambientale e l'igiene dell'acqua potabile e dell'ambiente.