Enfeksiyondan Korunma ve Çevre Hijyeni Departmanı enfeksiyondan korunma, içme suyu ve çevre hijyeninden sorumludur. Görevleri arasında bildirimi zorunlu hastalıkların tespiti, danışmanlık ve kayıt altına alınması, tesislerin enfeksiyon hijyeni denetimi, Stuttgart MRE ağının koordinasyonu, yetişkinler için aşı danışmanlığı, pandemi kontrolü, çevre tıbbı ve içme suyu ve çevre hijyeni yer almaktadır.