Отдел инфекционной защиты и гигиены окружающей среды отвечает за инфекционную защиту и гигиену питьевой воды и окружающей среды. В его задачи входит выявление, консультирование и регистрация регистрируемых заболеваний, контроль инфекционной гигиены в учреждениях, координация сети MRE в Штутгарте, консультирование по вакцинации взрослых, контроль пандемий, медицина окружающей среды, питьевая вода и гигиена окружающей среды.