Департамент общественного здравоохранения играет важную роль в борьбе с инфекционными заболеваниями в Германии. Ключевым инструментом является законодательно установленная система отчетности. Закон о защите от инфекций (IfSG) регламентирует, о каких заболеваниях необходимо сообщать в случае подозрения, болезни или смерти, а также какие лабораторные диагностические данные о патогенах необходимо сообщать. Команда, входящая в состав отдела инфекционной защиты, отвечает за выявление, консультирование и регистрацию подлежащих регистрации заболеваний.